Недоліки фітотерапії
складність встановлення дозування, від якого залежить результат лікування
обмежена кількість захворювань, що піддаються лікуванню травами
залежність ефективності впливу від таких факторів, як умови та терміни збирання, умови зберігання сировини та метод приготування фітопрепарату

лікарські рослини практично не проходять необхідні дослідження та перевірки
ризик отруєння, особливо при самостійному збиранні лікарських рослин
Поліпшення при фітотерапії спостерігається через 2-3 тижні лікування, але стійкого результату можна досягти лише за умови тривалого та регулярного застосування трав (не менше півроку). При цьому з метою запобігання рецидивам захворювання рекомендується приймати лікувальні збори двічі на рік протягом 2 місяців.